Hola Richard, saludos cordiales desde Caracas, bienvenido.
1.- Bien, hay muchas variables en cuanto a una falla de este tipo, primero tienes que cerciorarte que el motor este a punto, con esto quiero decir que el motor debe haber quedado bien calibrado, que no esté presentando fallas de encendido, minimo, que cuando lo aceleres sea contaste y regrese al rango de valor que seria entre 800 a 1000 rpm y se mantega estable, eso deberias revisarlo con un checking de la computadora para ver si te arroja errores.
2.- Pendiente con el alternador, ya que la corriente tiene que ser estable (13 V ~ 14.5 V) para que se mantega la chispa, ya que al aplicar una marcha en la caja el motor tiene mas trabajo y tal vez por eso no aguante.
3.- Verifica las valvulas de IAC , TPS, MAF, si fuera el caso esto concierne al punto 1.
4.- Tendrias que asegurarte al 100% que las conexiones electricas de la caja hayan quedado corrrectas, si no podria radicar la falla en ese ramal.
5.- Levanta el carro y aplica la caja con las ruedas en el aire, acelera en las marchas y si no se apaga, esto comprobaria el punto 2.
6.- Mi opinion sería primero descartar una falla con el alternador; enciende el auto, prende todas las luces, limpia parabrisas, radio, etc... Todo aquello que requiera corriente adicional para ver si se apaga, obviamente si sucede ya te darias cuenta que es problema de voltaje.
Con esto solo te doy una pequeña orientación, a veces los problemas que uno cree imposibles son los de mas facil y obvia solución. Es dificil en estos tiempos contar con una mano de obra mecanica experta y honesta, pero bueno aqui estamos para ayudarnos, veo que eres de Barcelona - Anzoategui, si te parece te dejo mi numero e intercambiamos ideas.
Suerte y feliz tarde.
Angel Mendoza 0416-0403604