puede ser que sea problema de los sincronizadores de tu caja de cambios.
Estos son los encargados de igualar velocidades de los piñones que se engranan .
Cuando estos fallan, los cambios suenan al pasar, y pasan dificilmente.
es sierto lo que dice guillermo pero por lo general no fallan todos los sincronisadores juntos, dinos en que marcha te cuesta, podria ser solo regulacion de piola y nada mas.