hola mira lo que primero tienes que hacer es ir por pasos para encontrar el daño rapido, segun lo que relatas el problema es de inyeccion, lo primero es determinar si la falla es por falta de suministro de combustible al riel o falta de alimentacion electrica en los inyectores, electronica, para esto retira la linea de entrada de combustible al riel y le miras presion debe ser mayor a 40 psi si no tienes manometro pon la linea a descarga directa en un galon y abres el swuitc ten en cuenta que dependiendo del sistema de inyeccion que tenga la bomba manda presion con el swuitch abierto o dando star al motor, si la presion se encuentra bien, entonces la descartas y te centras en los inyectores, estos tienen dos cables 12v y señal negativa, prueba dando sart la linea de los 12v si esta bien chequea el negativo con una punta logica con esta se puede determinar si en realidad hay señal de la computadora, si todo esto se encuentra bien debes desmontar y revisar los inyectores y el regulador de presion, a opinion personal si ya cambiaste la bomba de combustible puede ser la alimentacion electrica de esta prueba los 12v en los cables de alimentacion de esta, debes tener en cuenta de dar star para probar.
saludos y ojala lo puedas reparar, nos cuentas.